The Boondock Saints Overal is criminaliteit en sommige van de ergste misdadigers worden maar niet bestraft.

Daar hebben de broertjes Connor (Sean Patrick Flanery) en Murphy McManus (Norman Reedus) schoon genoeg van. Na een uit de hand gelopen vechtpartij waarbij wat criminelen het leven laten, nemen ze samen met hun vriend Rocco het recht in eigen hand. Systematisch beginnen ze de grootste gangsters af te slachten.

FBI agent Paul Smecker (Willem Dafoe) raakt de mannen op het spoor. Hij zou ze moeten oppakken, maar …. Hij neemt een levensgevaarlijk besluit.